Красимир Генчев Балъков е роден е на 29 март 1966 г. във Велико Търново. Висок е 176 см и тежи 75 кг. Футболната му кариера прминава през Етър, Велико Търново 1983-1990, Спортинг, Лисабон 1991-1995 и Щутгарт 1995-2003. В „А“ група с екипа на Етър има изиграни 143 мача и 35 отбелязани гола. С екипа на отбора от Велико Търново става шампион на Република България за сезон 1990/1991 г., печели бронзов медал за сезон 1989/1990 г., както и трето място за Купата на България през 1986 г.
В „Спортинг” Лисабон изиграва 138 мача и отбелязва 43 гола. През 1995 печели Купата и Суперкупата на Португалия, финалист за купата през 1994, вицешампион през 1995 и бронзов медалист през 1991, 1993 и 1994. Обявен е за най-добър футболист в Португалската Суперлига през 1992 г. от в. „А Бола“.
С екипа на Щутгарт изиграва 236 мача и отбелязва 54 гола. „Магическото трио“ Балъков-Бобич-Елбер прави фурор още в първия сезон на българина в тима. Носител на Купата на Германия през 1997, вицешампион през 2003, финалист за КНК през 1998, носител на Купа Интертото през 2000 и 2002 г. Определен е от привържениците на тима за най-добър играч в историята на Щутгарт.
За Националния отбор на България дебютира на 2 ноември 1988 г. в световна квалификация срещу Дания (1:1 в Копенхаген). Последният му мач е на 30 април 2003 г. срещу Албания (2:0 в София). Изиграл е 92 мача, в които е отбелязал 16 гола. Участва на Световното първенство през 1994 в САЩ, където става бронзов медалист. Играе във всичките 7 мача и намира място в идеалния отбор на първенството. Участва и на Световното първенство през 1998 във Франция, където играе в 3 мача, както и на Европейското първенство през 1996 в Англия, където записва също 3 мача. Избран е за Футболист № 1 на България през 1995 и 1997 г
На 29 май 2003 г. на Готлиб Даймлер Щадион в Щутгарт се състои бенефисната среща на Балъков, като един срещу друг се изправят „Дрийм тим“, съставен от световни звезди като Бебето, Юрген Клинсман, Томас Хеслер, Гуидо Бухвалд, Роберт Просинечки Борислав Михайлов Йордан Лечков, Емил Костадинов, Любослав Пенев и отбор съставен от негови бивши съотборници като Дунга, Джоване Елбер, Фреди Бобич и др.
Веднага след прекратяване на състезателната си кариера Балъков става помощник-треньор на Щутгарт от юли 2003, като работи под ръководството на Феликс Магат и на Матиас Замер. Тандемът и с двамата старши-треньори се доказва като успешен, успявайки да класира отбора в две последователни години в груповата фаза на Шампионската лига, а впоследствие и в груповата фаза на турнира за Купата на УЕФА.
От януари 2006 г. стартира и неговата самостоятелна треньорска кариера – поема швейцарския Грасхопърс, като подписва договор за година и половина. С Грасхопърс печели Купа Интертото, участва впоследствие в груповата фаза на турнира за Купата на УЕФА и е дълго време водач на класирането за сезон 2006/2007 в местната Супер Лига.
От октомври 2007 поема последния в класирането ФК Санкт Гален, който в дадения момент изостава на 12 точки от място, даващо право на баражи. С много труд и подобряване на спортната форма и резултати отборът успява да навакса изоставането и да се класира в крайна сметка в зоната даваща право на баражи.
От януари 2008-ма година до декември 2010-та Красимир Балъков е старши треньор на „Черноморец” Бургас. Заедно със своя съотборник от Щутгарт Фреди Бобич изготвят сериозен проект за дългосрочното развитие на клуба от град Бургас. Изграждане на база за отбора по стандарти от развити футболни страни, в която ще се подготвят първият отбор и част от юношеските формации на Черноморец. Проектът обаче не се изпълнява поради административни проблеми в ръководството на компанията, собственик на отбора. Под ръководството на Балъков отборът на „Черноморец” Бургас изиграва 60 мача, в които записва 29 победи, 16 завършва наравно и губи 15 мача.
От май 2011 до март 2012 година Красимир Балъков е мениджър на отбора на Хайдук Сплит. Тимът е втори във временното класиране и сигурен участник в Евротурнирите. В Хайдук Сплит Балъков записва общо 28 мача като старши треньор, в които постига 16 победи, 5 равни и 7 загуби.
През март 2012 година по предложение на Спортно-техническото ръководство на Кайзерслаутерн Балъков преминава в тима от Бундеслигата. Отборът е на незавидното последно място, като повече от шест месеца не е побеждавал в мач за първенството. Балъков опитва всичко, за да помогне на тима и да го спаси от отпадане, но без успех и Кайзерслаутерн отпада във втора Бундеслига.